Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPSAP08865 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPSAP08865 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPSAP08865 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPSAP08865 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPSAP08865 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPSAP08865 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPSAP08865 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPSAP08865 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPSAP08865 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPSAP08865 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPSAP08865 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPSAP08865 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPSAP08865 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPSAP08865 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPSAP08865 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPSAP08865 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPSAP08865 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPSAP08865 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPSAP08865 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPSAP08865 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPSAP08865 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPSAP08865 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPSAP08865 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPSAP08865 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPSAP08865 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPSAP08865 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPSAP08865 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPSAP08865 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPSAP08865 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPSAP08865 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPSAP08865 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPSAP08865 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPSAP08865 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPSAP08865 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPSAP08865 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPSAP08865 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPSAP08865 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RPSAP08865 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPSAP08865 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPSAP08865 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPSAP08865 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPSAP08865 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPSAP08865 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPSAP08865 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPSAP08865 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPSAP08865 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPSAP08865 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPSAP08865 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPSAP08865 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPSAP08865 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPSAP08865 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPSAP08865 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPSAP08865 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPSAP08865 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPSAP08865 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPSAP08865 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPSAP08865 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPSAP08865 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPSAP08865 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPSAP08865 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPSAP08865 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPSAP08865 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPSAP08865 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPSAP08865 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPSAP08865 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPSAP08865 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPSAP08865 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPSAP08865 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPSAP08865 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPSAP08865 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPSAP08865 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPSAP08865 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPSAP08865 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPSAP08865 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPSAP08865 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPSAP08865 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPSAP08865 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPSAP08865 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPSAP08865 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPSAP08865 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPSAP08865 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPSAP08865 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPSAP08865 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPSAP08865 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPSAP08865 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPSAP08865 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPSAP08865 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPSAP08865 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPSAP08865 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPSAP08865 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPSAP08865 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPSAP08865 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPSAP08865 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPSAP08865 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPSAP08865 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPSAP08865 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPSAP08865 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPSAP08865 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPSAP08865 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms