Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRAP08240 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPRAP08240 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPRAP08240 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRAP08240 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRPRAP08240 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRPRAP08240 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRAP08240 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRAP08240 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRPRAP08240 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms