Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM3P06753 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPM3P06753 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPM3P06753 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM3P06753 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM3P06753 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM3P06753 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPM3P06753 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPM3P06753 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TPM3P06753 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPM3P06753 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPM3P06753 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM3P06753 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPM3P06753 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPM3P06753 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPM3P06753 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPM3P06753 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPM3P06753 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPM3P06753 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPM3P06753 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPM3P06753 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPM3P06753 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPM3P06753 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPM3P06753 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPM3P06753 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPM3P06753 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPM3P06753 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPM3P06753 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPM3P06753 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPM3P06753 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPM3P06753 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPM3P06753 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TPM3P06753 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPM3P06753 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPM3P06753 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPM3P06753 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPM3P06753 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TPM3P06753 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPM3P06753 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPM3P06753 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPM3P06753 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPM3P06753 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPM3P06753 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPM3P06753 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TPM3P06753 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPM3P06753 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPM3P06753 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPM3P06753 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM3P06753 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM3P06753 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPM3P06753 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPM3P06753 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPM3P06753 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPM3P06753 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPM3P06753 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPM3P06753 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM3P06753 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM3P06753 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPM3P06753 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM3P06753 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM3P06753 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPM3P06753 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPM3P06753 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPM3P06753 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM3P06753 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM3P06753 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPM3P06753 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPM3P06753 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPM3P06753 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPM3P06753 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPM3P06753 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TPM3P06753 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPM3P06753 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPM3P06753 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPM3P06753 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TPM3P06753 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TPM3P06753 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TPM3P06753 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TPM3P06753 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TPM3P06753 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TPM3P06753 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TPM3P06753 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TPM3P06753 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPM3P06753 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPM3P06753 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPM3P06753 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPM3P06753 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TPM3P06753 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPM3P06753 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPM3P06753 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TPM3P06753 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TPM3P06753 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPM3P06753 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPM3P06753 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPM3P06753 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPM3P06753 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPM3P06753 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPM3P06753 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPM3P06753 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TPM3P06753 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms