Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLBP06746 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLBP06746 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLBP06746 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLBP06746 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLBP06746 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLBP06746 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLBP06746 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLBP06746 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLBP06746 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLBP06746 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLBP06746 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLBP06746 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLBP06746 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLBP06746 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLBP06746 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLBP06746 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLBP06746 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLBP06746 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLBP06746 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLBP06746 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLBP06746 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLBP06746 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLBP06746 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLBP06746 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLBP06746 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLBP06746 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLBP06746 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLBP06746 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLBP06746 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLBP06746 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLBP06746 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLBP06746 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLBP06746 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLBP06746 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLBP06746 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLBP06746 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLBP06746 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLBP06746 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLBP06746 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLBP06746 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLBP06746 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLBP06746 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLBP06746 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLBP06746 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLBP06746 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLBP06746 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLBP06746 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLBP06746 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLBP06746 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLBP06746 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLBP06746 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLBP06746 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLBP06746 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLBP06746 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLBP06746 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLBP06746 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLBP06746 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLBP06746 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLBP06746 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLBP06746 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLBP06746 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLBP06746 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLBP06746 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLBP06746 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLBP06746 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLBP06746 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLBP06746 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLBP06746 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLBP06746 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLBP06746 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLBP06746 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLBP06746 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLBP06746 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLBP06746 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLBP06746 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLBP06746 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLBP06746 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLBP06746 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLBP06746 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLBP06746 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLBP06746 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLBP06746 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLBP06746 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLBP06746 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLBP06746 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLBP06746 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLBP06746 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLBP06746 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLBP06746 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLBP06746 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLBP06746 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLBP06746 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLBP06746 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLBP06746 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLBP06746 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLBP06746 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLBP06746 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLBP06746 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLBP06746 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms