Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK1P06493 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK1P06493 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK1P06493 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK1P06493 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK1P06493 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK1P06493 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK1P06493 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK1P06493 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK1P06493 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK1P06493 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK1P06493 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK1P06493 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK1P06493 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK1P06493 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK1P06493 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK1P06493 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK1P06493 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK1P06493 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK1P06493 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK1P06493 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK1P06493 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK1P06493 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK1P06493 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK1P06493 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK1P06493 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK1P06493 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK1P06493 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK1P06493 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK1P06493 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK1P06493 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK1P06493 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK1P06493 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK1P06493 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK1P06493 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK1P06493 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK1P06493 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK1P06493 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK1P06493 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK1P06493 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK1P06493 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK1P06493 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK1P06493 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK1P06493 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK1P06493 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK1P06493 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK1P06493 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK1P06493 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK1P06493 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK1P06493 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK1P06493 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK1P06493 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK1P06493 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK1P06493 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK1P06493 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK1P06493 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK1P06493 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK1P06493 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK1P06493 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK1P06493 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK1P06493 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK1P06493 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK1P06493 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK1P06493 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK1P06493 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK1P06493 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK1P06493 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK1P06493 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK1P06493 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK1P06493 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK1P06493 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK1P06493 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK1P06493 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK1P06493 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK1P06493 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK1P06493 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK1P06493 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK1P06493 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK1P06493 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK1P06493 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK1P06493 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK1P06493 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK1P06493 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK1P06493 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK1P06493 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK1P06493 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK1P06493 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK1P06493 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK1P06493 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK1P06493 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK1P06493 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK1P06493 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK1P06493 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK1P06493 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK1P06493 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK1P06493 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK1P06493 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK1P06493 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK1P06493 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK1P06493 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms