Protein–RNA interactions for Protein: P05814

CSN2, Beta-casein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN2P05814 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSN2P05814 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSN2P05814 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSN2P05814 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSN2P05814 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN2P05814 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN2P05814 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN2P05814 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN2P05814 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSN2P05814 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSN2P05814 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSN2P05814 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN2P05814 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN2P05814 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN2P05814 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN2P05814 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSN2P05814 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSN2P05814 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSN2P05814 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSN2P05814 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSN2P05814 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSN2P05814 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSN2P05814 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSN2P05814 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSN2P05814 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSN2P05814 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSN2P05814 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSN2P05814 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSN2P05814 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSN2P05814 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSN2P05814 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSN2P05814 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSN2P05814 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSN2P05814 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSN2P05814 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSN2P05814 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSN2P05814 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSN2P05814 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSN2P05814 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSN2P05814 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSN2P05814 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSN2P05814 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSN2P05814 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSN2P05814 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSN2P05814 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSN2P05814 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSN2P05814 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSN2P05814 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSN2P05814 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSN2P05814 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSN2P05814 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSN2P05814 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSN2P05814 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSN2P05814 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSN2P05814 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSN2P05814 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSN2P05814 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSN2P05814 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSN2P05814 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSN2P05814 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSN2P05814 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSN2P05814 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSN2P05814 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSN2P05814 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSN2P05814 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSN2P05814 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSN2P05814 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSN2P05814 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSN2P05814 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSN2P05814 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSN2P05814 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSN2P05814 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSN2P05814 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSN2P05814 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSN2P05814 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSN2P05814 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSN2P05814 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSN2P05814 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSN2P05814 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSN2P05814 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSN2P05814 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSN2P05814 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSN2P05814 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSN2P05814 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSN2P05814 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSN2P05814 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSN2P05814 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN2P05814 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN2P05814 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN2P05814 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN2P05814 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSN2P05814 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSN2P05814 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSN2P05814 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSN2P05814 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSN2P05814 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSN2P05814 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSN2P05814 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSN2P05814 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSN2P05814 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms