Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG5P05408 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG5P05408 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG5P05408 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG5P05408 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG5P05408 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG5P05408 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG5P05408 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG5P05408 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG5P05408 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCG5P05408 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG5P05408 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG5P05408 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG5P05408 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG5P05408 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG5P05408 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG5P05408 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG5P05408 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG5P05408 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG5P05408 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG5P05408 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG5P05408 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG5P05408 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG5P05408 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG5P05408 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG5P05408 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG5P05408 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG5P05408 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCG5P05408 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCG5P05408 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG5P05408 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG5P05408 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG5P05408 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG5P05408 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG5P05408 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG5P05408 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG5P05408 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG5P05408 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG5P05408 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG5P05408 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG5P05408 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG5P05408 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG5P05408 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG5P05408 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG5P05408 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG5P05408 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG5P05408 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG5P05408 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG5P05408 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG5P05408 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG5P05408 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG5P05408 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG5P05408 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG5P05408 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG5P05408 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG5P05408 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG5P05408 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG5P05408 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG5P05408 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG5P05408 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG5P05408 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG5P05408 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG5P05408 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG5P05408 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG5P05408 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG5P05408 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG5P05408 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG5P05408 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG5P05408 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG5P05408 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG5P05408 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG5P05408 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG5P05408 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG5P05408 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG5P05408 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG5P05408 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG5P05408 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG5P05408 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG5P05408 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG5P05408 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG5P05408 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG5P05408 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG5P05408 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCG5P05408 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms