Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA6P05013 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA6P05013 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA6P05013 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA6P05013 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA6P05013 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNA6P05013 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA6P05013 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA6P05013 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms