Protein–RNA interactions for Protein: P00519

ABL1, Tyrosine-protein kinase ABL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABL1P00519 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABL1P00519 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABL1P00519 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABL1P00519 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABL1P00519 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABL1P00519 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABL1P00519 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABL1P00519 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABL1P00519 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABL1P00519 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABL1P00519 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABL1P00519 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABL1P00519 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ABL1P00519 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABL1P00519 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABL1P00519 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABL1P00519 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABL1P00519 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABL1P00519 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABL1P00519 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABL1P00519 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABL1P00519 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABL1P00519 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABL1P00519 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABL1P00519 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABL1P00519 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABL1P00519 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABL1P00519 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABL1P00519 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABL1P00519 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABL1P00519 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABL1P00519 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABL1P00519 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABL1P00519 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ABL1P00519 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABL1P00519 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABL1P00519 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABL1P00519 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABL1P00519 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABL1P00519 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABL1P00519 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABL1P00519 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABL1P00519 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABL1P00519 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABL1P00519 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABL1P00519 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABL1P00519 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABL1P00519 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABL1P00519 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABL1P00519 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABL1P00519 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABL1P00519 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABL1P00519 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABL1P00519 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABL1P00519 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABL1P00519 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABL1P00519 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABL1P00519 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABL1P00519 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ABL1P00519 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABL1P00519 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABL1P00519 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABL1P00519 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABL1P00519 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABL1P00519 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABL1P00519 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABL1P00519 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABL1P00519 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABL1P00519 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABL1P00519 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABL1P00519 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABL1P00519 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABL1P00519 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABL1P00519 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABL1P00519 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABL1P00519 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABL1P00519 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABL1P00519 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABL1P00519 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABL1P00519 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABL1P00519 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABL1P00519 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABL1P00519 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABL1P00519 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABL1P00519 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABL1P00519 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABL1P00519 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABL1P00519 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABL1P00519 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABL1P00519 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABL1P00519 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABL1P00519 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABL1P00519 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABL1P00519 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABL1P00519 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABL1P00519 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABL1P00519 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABL1P00519 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABL1P00519 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABL1P00519 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms