Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHEK2O96017 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHEK2O96017 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHEK2O96017 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CHEK2O96017 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHEK2O96017 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHEK2O96017 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHEK2O96017 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHEK2O96017 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHEK2O96017 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms