Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT4O95628 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT4O95628 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT4O95628 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT4O95628 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT4O95628 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms