Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC2O95347 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC2O95347 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC2O95347 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC2O95347 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC2O95347 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC2O95347 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC2O95347 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC2O95347 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC2O95347 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC2O95347 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC2O95347 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMC2O95347 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC2O95347 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC2O95347 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC2O95347 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMC2O95347 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC2O95347 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC2O95347 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC2O95347 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC2O95347 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC2O95347 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC2O95347 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC2O95347 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC2O95347 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC2O95347 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC2O95347 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC2O95347 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC2O95347 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC2O95347 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC2O95347 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC2O95347 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMC2O95347 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC2O95347 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC2O95347 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC2O95347 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC2O95347 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC2O95347 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC2O95347 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC2O95347 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC2O95347 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC2O95347 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC2O95347 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC2O95347 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC2O95347 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC2O95347 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC2O95347 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC2O95347 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC2O95347 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC2O95347 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC2O95347 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC2O95347 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC2O95347 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC2O95347 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC2O95347 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC2O95347 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC2O95347 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC2O95347 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMC2O95347 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMC2O95347 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC2O95347 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC2O95347 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC2O95347 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC2O95347 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC2O95347 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC2O95347 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC2O95347 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC2O95347 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC2O95347 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC2O95347 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC2O95347 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMC2O95347 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC2O95347 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC2O95347 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC2O95347 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC2O95347 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC2O95347 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC2O95347 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC2O95347 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC2O95347 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC2O95347 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC2O95347 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC2O95347 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC2O95347 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC2O95347 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC2O95347 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC2O95347 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC2O95347 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC2O95347 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC2O95347 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC2O95347 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC2O95347 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC2O95347 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC2O95347 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC2O95347 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC2O95347 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC2O95347 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC2O95347 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC2O95347 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC2O95347 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms