Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR3BO95264 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3BO95264 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3BO95264 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3BO95264 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms