Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCELO95171 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCELO95171 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCELO95171 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCELO95171 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCELO95171 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCELO95171 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCELO95171 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCELO95171 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCELO95171 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCELO95171 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCELO95171 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCELO95171 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCELO95171 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCELO95171 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCELO95171 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCELO95171 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCELO95171 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCELO95171 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCELO95171 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCELO95171 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCELO95171 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCELO95171 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCELO95171 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCELO95171 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCELO95171 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCELO95171 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCELO95171 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCELO95171 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms