Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCELO95171 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCELO95171 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCELO95171 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCELO95171 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCELO95171 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCELO95171 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCELO95171 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCELO95171 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCELO95171 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCELO95171 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCELO95171 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCELO95171 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCELO95171 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCELO95171 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCELO95171 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCELO95171 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCELO95171 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCELO95171 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCELO95171 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCELO95171 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCELO95171 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCELO95171 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCELO95171 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCELO95171 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCELO95171 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCELO95171 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCELO95171 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCELO95171 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCELO95171 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCELO95171 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCELO95171 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCELO95171 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCELO95171 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCELO95171 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCELO95171 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCELO95171 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCELO95171 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCELO95171 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCELO95171 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCELO95171 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCELO95171 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms