Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLSTN1O94985 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSTN1O94985 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSTN1O94985 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSTN1O94985 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSTN1O94985 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms