Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3AO75631 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UPK3AO75631 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPK3AO75631 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3AO75631 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK3AO75631 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3AO75631 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms