Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3BO75182 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIN3BO75182 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3BO75182 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3BO75182 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SIN3BO75182 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIN3BO75182 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms