Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms