Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GFRA3O60609 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFRA3O60609 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GFRA3O60609 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GFRA3O60609 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GFRA3O60609 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA3O60609 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GFRA3O60609 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFRA3O60609 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms