Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DFNA5O60443 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DFNA5O60443 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DFNA5O60443 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DFNA5O60443 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DFNA5O60443 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DFNA5O60443 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DFNA5O60443 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DFNA5O60443 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFNA5O60443 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DFNA5O60443 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DFNA5O60443 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DFNA5O60443 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DFNA5O60443 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DFNA5O60443 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DFNA5O60443 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DFNA5O60443 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms