Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME2P1O60361 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME2P1O60361 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME2P1O60361 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME2P1O60361 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms