Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HTATSF1O43719 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HTATSF1O43719 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
HTATSF1O43719 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
HTATSF1O43719 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HTATSF1O43719 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HTATSF1O43719 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HTATSF1O43719 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HTATSF1O43719 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
HTATSF1O43719 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HTATSF1O43719 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HTATSF1O43719 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HTATSF1O43719 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms