Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF4O43474 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF4O43474 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF4O43474 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF4O43474 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF4O43474 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF4O43474 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF4O43474 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF4O43474 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF4O43474 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF4O43474 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF4O43474 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF4O43474 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF4O43474 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF4O43474 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF4O43474 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF4O43474 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF4O43474 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF4O43474 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF4O43474 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF4O43474 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF4O43474 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF4O43474 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF4O43474 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF4O43474 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF4O43474 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF4O43474 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF4O43474 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF4O43474 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF4O43474 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF4O43474 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF4O43474 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF4O43474 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF4O43474 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF4O43474 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF4O43474 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF4O43474 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF4O43474 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF4O43474 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF4O43474 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF4O43474 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF4O43474 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF4O43474 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF4O43474 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF4O43474 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF4O43474 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF4O43474 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF4O43474 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF4O43474 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF4O43474 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF4O43474 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF4O43474 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF4O43474 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF4O43474 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF4O43474 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLF4O43474 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF4O43474 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF4O43474 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF4O43474 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLF4O43474 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLF4O43474 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF4O43474 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF4O43474 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF4O43474 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF4O43474 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF4O43474 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF4O43474 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF4O43474 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF4O43474 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF4O43474 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLF4O43474 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLF4O43474 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF4O43474 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF4O43474 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF4O43474 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF4O43474 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF4O43474 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF4O43474 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF4O43474 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF4O43474 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF4O43474 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF4O43474 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLF4O43474 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLF4O43474 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF4O43474 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF4O43474 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF4O43474 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF4O43474 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF4O43474 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF4O43474 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF4O43474 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF4O43474 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms