Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EEF1E1O43324 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EEF1E1O43324 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EEF1E1O43324 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEF1E1O43324 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1E1O43324 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms