Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A4O43246 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC7A4O43246 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC7A4O43246 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC7A4O43246 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC7A4O43246 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC7A4O43246 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms