Protein–RNA interactions for Protein: O15305

PMM2, Phosphomannomutase 2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM2O15305 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PMM2O15305 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PMM2O15305 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PMM2O15305 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PMM2O15305 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PMM2O15305 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PMM2O15305 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PMM2O15305 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PMM2O15305 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PMM2O15305 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMM2O15305 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMM2O15305 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PMM2O15305 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PMM2O15305 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PMM2O15305 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PMM2O15305 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PMM2O15305 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PMM2O15305 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PMM2O15305 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PMM2O15305 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMM2O15305 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMM2O15305 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMM2O15305 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PMM2O15305 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PMM2O15305 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PMM2O15305 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PMM2O15305 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PMM2O15305 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PMM2O15305 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PMM2O15305 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PMM2O15305 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PMM2O15305 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PMM2O15305 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PMM2O15305 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PMM2O15305 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PMM2O15305 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PMM2O15305 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PMM2O15305 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PMM2O15305 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PMM2O15305 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMM2O15305 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMM2O15305 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PMM2O15305 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMM2O15305 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PMM2O15305 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PMM2O15305 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PMM2O15305 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PMM2O15305 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PMM2O15305 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PMM2O15305 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PMM2O15305 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PMM2O15305 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PMM2O15305 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PMM2O15305 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PMM2O15305 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PMM2O15305 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PMM2O15305 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PMM2O15305 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PMM2O15305 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PMM2O15305 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PMM2O15305 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PMM2O15305 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PMM2O15305 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PMM2O15305 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMM2O15305 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMM2O15305 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMM2O15305 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PMM2O15305 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMM2O15305 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMM2O15305 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMM2O15305 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PMM2O15305 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PMM2O15305 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PMM2O15305 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PMM2O15305 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PMM2O15305 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PMM2O15305 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PMM2O15305 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PMM2O15305 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PMM2O15305 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PMM2O15305 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PMM2O15305 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PMM2O15305 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PMM2O15305 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PMM2O15305 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PMM2O15305 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PMM2O15305 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PMM2O15305 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PMM2O15305 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PMM2O15305 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PMM2O15305 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PMM2O15305 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PMM2O15305 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PMM2O15305 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PMM2O15305 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PMM2O15305 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PMM2O15305 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PMM2O15305 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PMM2O15305 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PMM2O15305 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms