Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PER2O15055 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PER2O15055 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PER2O15055 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PER2O15055 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PER2O15055 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PER2O15055 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PER2O15055 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PER2O15055 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PER2O15055 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PER2O15055 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PER2O15055 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PER2O15055 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PER2O15055 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PER2O15055 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PER2O15055 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PER2O15055 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PER2O15055 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PER2O15055 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PER2O15055 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PER2O15055 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PER2O15055 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PER2O15055 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PER2O15055 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PER2O15055 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PER2O15055 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PER2O15055 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PER2O15055 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PER2O15055 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PER2O15055 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PER2O15055 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PER2O15055 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PER2O15055 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER2O15055 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER2O15055 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER2O15055 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PER2O15055 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER2O15055 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER2O15055 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER2O15055 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER2O15055 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PER2O15055 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PER2O15055 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PER2O15055 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PER2O15055 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER2O15055 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PER2O15055 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER2O15055 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PER2O15055 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PER2O15055 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER2O15055 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PER2O15055 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER2O15055 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER2O15055 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER2O15055 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER2O15055 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER2O15055 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER2O15055 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER2O15055 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER2O15055 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER2O15055 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER2O15055 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER2O15055 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PER2O15055 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER2O15055 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER2O15055 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER2O15055 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER2O15055 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER2O15055 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER2O15055 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER2O15055 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER2O15055 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER2O15055 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER2O15055 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER2O15055 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER2O15055 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PER2O15055 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PER2O15055 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PER2O15055 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PER2O15055 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PER2O15055 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PER2O15055 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PER2O15055 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms