Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDMT1O14717 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRDMT1O14717 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDMT1O14717 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRDMT1O14717 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRDMT1O14717 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRDMT1O14717 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRDMT1O14717 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRDMT1O14717 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRDMT1O14717 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRDMT1O14717 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRDMT1O14717 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRDMT1O14717 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRDMT1O14717 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRDMT1O14717 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRDMT1O14717 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRDMT1O14717 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRDMT1O14717 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRDMT1O14717 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRDMT1O14717 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDMT1O14717 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDMT1O14717 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms