Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2O14595 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSP2O14595 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTDSP2O14595 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2O14595 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2O14595 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSP2O14595 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSP2O14595 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms