Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BRM9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BRM9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BRM9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BRM9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H3BRM9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H3BRM9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H3BRM9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BRM9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H3BRM9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BRM9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BRM9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H3BRM9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BRM9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H3BRM9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BRM9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BRM9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BRM9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BRM9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BRM9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BRM9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H3BRM9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H3BRM9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H3BRM9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H3BRM9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H3BRM9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H3BRM9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H3BRM9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H3BRM9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H3BRM9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H3BRM9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H3BRM9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H3BRM9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H3BRM9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H3BRM9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H3BRM9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H3BRM9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H3BRM9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H3BRM9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H3BRM9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H3BRM9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H3BRM9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H3BRM9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H3BRM9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H3BRM9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H3BRM9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H3BRM9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3BRM9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3BRM9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3BRM9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3BRM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3BRM9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3BRM9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3BRM9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H3BRM9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H3BRM9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BRM9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BRM9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BRM9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BRM9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BRM9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BRM9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BRM9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BRM9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BRM9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BRM9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BRM9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BRM9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BRM9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BRM9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BRM9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BRM9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BRM9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BRM9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BRM9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BRM9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BRM9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BRM9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BRM9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BRM9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BRM9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BRM9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BRM9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BRM9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BRM9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BRM9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BRM9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BRM9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BRM9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BRM9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BRM9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BRM9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BRM9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BRM9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BRM9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BRM9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BRM9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BRM9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BRM9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BRM9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms