Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK7

CPSF4L, Putative cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF4LA6NMK7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPSF4LA6NMK7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPSF4LA6NMK7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPSF4LA6NMK7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPSF4LA6NMK7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPSF4LA6NMK7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms