Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD8B2A6NJW9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD8B2A6NJW9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD8B2A6NJW9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CD8B2A6NJW9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD8B2A6NJW9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms