Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERINC4A6NH21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SERINC4A6NH21 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SERINC4A6NH21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERINC4A6NH21 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERINC4A6NH21 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERINC4A6NH21 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERINC4A6NH21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERINC4A6NH21 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERINC4A6NH21 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERINC4A6NH21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SERINC4A6NH21 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms