Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
WIPF3A6NGB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WIPF3A6NGB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WIPF3A6NGB9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WIPF3A6NGB9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WIPF3A6NGB9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WIPF3A6NGB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms