Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HELTA6NFD8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HELTA6NFD8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELTA6NFD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HELTA6NFD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELTA6NFD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms