Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPDC1A2A3K4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPDC1A2A3K4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPDC1A2A3K4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPDC1A2A3K4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPDC1A2A3K4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms