Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF2Q9Y5W3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms