Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC1Q9Y3B2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC1Q9Y3B2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms