Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP20Q9Y2K6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms