Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ICE1Q9Y2F5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms