Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZRN3Q9UPQ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZRN3Q9UPQ7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms