Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP1Q9UPQ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP1Q9UPQ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms