Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms