Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA4Q9UN74 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms