Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND2AQ9ULE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms