Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms