Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN16Q9UKR8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN16Q9UKR8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms