Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJD2Q9UKL4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJD2Q9UKL4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms