Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CHIC2Q9UKJ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms