Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAX2Q9UIW0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms